高通量精準奈米孔單分子基因定序技術

多基因位點序列分型(multilocus sequence typing, MLST)是一種分析病原菌分子流行病學的方法,利用聚合酶連鎖反應(polymerase chain reaction, PCR)針對微生物7至10個管家基因(housekeeping genes)進行增幅,經由核酸定序及序列的比對分析,可得知菌株的品系及親源關係。由於序列型別方便在各地區分析比較不同菌株品系,使其成為研究分子流行病學的重要方法,亦為監控病原微生物爆發的重要工具。然而,傳統使用第一代DNA定序(Sanger定序)耗時且成本昂貴降低了此技術的實際應用,雖然隨著次世代定序(next-generation sequencing, NGS)技術的引入可同時針對多樣品進行高通量的精準定序,著實改善效率及成本問題,但二代定序技術受限其定序長度,不符合長片段的高通量精準多基因位點定序需求。